昭和13年5月23日「保証責任周東医療利用組合聯合会」として設立許可を受け、経営母体となる病院を玖珂郡柳井町白潟1069番地の1に建設する事になり、翌14年5月16日木造本館2階建1棟、病棟2階建2棟の当時では近代化された施設が完成し、業務を開始いたしました。
当地を選択した理由は周東3郡（大島、玖珂、熊毛）の基幹病院としての役割を果たせる施設としての立地条件を考慮したことであり、その後に分院や診療所を開設、農村漁村民の医療、福祉の拡大整備を図って行いました。昭和26年3月に廃止するまでの10年間は付属施設として「周東病院付属産婆看護婦養成所」も開設しました。この後、「周東利用聯」は「山口県産業組合聯合会」へ合併し戦時下の昭和18年9月農業団体法の下、県農業会へ統合されました。23年8月15日山口県厚生連が設立され、同時に県農業会の資産を譲り受け現在の厚生連病院として再出発いたしました。
25年3月深部治療室（レントゲン室）設置、28年診療棟・病棟を大改築、総合病院としての必要施設をその後新築し、29年1月より「総合病院」の名称認可を得て「周東総合病院」となりました。昭和28年3月には柳井町ほか6か村共立伝染病隔離病舎組合の伝染病棟も併設されていました。昭和14年に建設した施設は土木建築であったため、旧式と老朽化が著しく20年間を経過した36年頃から近代化へ向け検討が始まりましたが、当時は整備促進期間中で実現には至りませんでした。
41年6月県連合会の共通役員制が発足、周東・長門・小郡の3病院を基幹病院として診療設備の抜本的近代化を図り建物を永久建築とした改築方針が打ち出され、同年11月理事会で新病院の建設方針と建築場所が決定され、周東総合病院建設委員会の設置を決め具体化に入りました。
建設場所は近代的な総合病院を建設するには1万坪（3万3000㎡）以上の広大な用地を必要とするため同場所では狭く、また全施設を一挙に改築する事は技術的にも不可能なため、同年11月第1回建設委員会を開催し建設候補地3ヶ所を視察し、柳井市と平生町の境界に近い国道沿いの現在地に建設することに決定しました。現在地（柳井市古開作1000番1）への新築移転では柳井市・熊毛郡両医師会との間で種々の問題もあったが、山口県、県医師会、山口赤十字病院長、柳井市長などの労により「周東総合病院医療保健協議会設置」の覚書を取り交わす事で円満解決しました。
境界に建設する事で柳井市民病院と平生国保病院を吸収合併する形で43年2月12日着工、翌44年5月1日に完工しました。また地域における基幹病院を目指して医局を充実する為、山口大学との折衝の結果、年次増員する事で見通しが立ち、また救急医療に備えて医師住宅も同一敷地内に次々と建設して行きました。
しかし経営状態は新築移転したものの増員した医師や職員の人件費、増大した減価償却費、金利などで経営は昭和48年度まで苦しい時期が続きましたが、翌49年度からは好転し黒字経営となりました。